Tajvanon körülbelül harminc vallási szervezet van bejegyezve a belügyminisztérium vallásügyi részlegénél. A vallási szervezetek a központi hatóságok szigetszerte megtalálható irodáiban jegyeztethetik be magukat a Templomigazgatási törvény, a Civil szervezetekre vonatkozó törvény, illetve a Polgári törvénykönyv alapítványokról és egyesületekről szóló része szerint. 2003. március 14‑én Tajvan Belügyminisztériuma felvette a Szcientológia Egyházat a hivatalosan elismert vallási szervezetek listájára.
„Amint a kérelmező új vallásnak minősül, tájékoztatásul adatokat kell benyújtania a saját vallási tanairól, céljairól, írásairól, szertartásairól, a vallási szervezetei felépítéséről stb. a minisztériumnak. Következésképpen az önök szervezete jóváhagyást kapott, hogy országos vallási szervezetté váljon. Tehát most már tény: a szervezetük elfogadásra került új vallásként.”